對厚樣品成像時，熒光顯微鏡法達到了極限。可見光在生物組織中強烈散射，因此熒光成像僅限于約100 μm的成像深度。

   相反，多光子顯微鏡利用紅外光中的激發波長，從而減少了較長波長的散射。這使多光子成像成為厚切片和活體動物深部組織成像的理想工具。應用范圍從可視化整個大腦的復雜結構到研究腫瘤的發展和轉移 或活體動物免疫系統的反應。

   多光子顯微鏡能成像多深取決于組織類型，組織年齡，染色質量，還取決于與多光子激光器的峰值功率相關的激發效率以及該峰值能在多大程度上保持。成像系統。

   該視頻介紹了用于深部組織成像的多光子顯微鏡的原理。